Надо как-то приучаться к пониманию структуры организации сайта. Установил я счётчики в footer.php, а они возьми и перестань показываться при любом изменении темы или обновлении wordpress. Неужели в самом сердце wordpress нет такого места, где можно было бы раз и навсегда счётчики запихать? Я ж не про рекламу говорю, а про фактически невидимые элементы!